Tal y como cabría esperar en un humedal, los anfibios están bien representados en las asociación fósil de Las Hoyas. Estos incluyen ranas, salamandras y las formas actualmente extintas conocidas como albanerpetóntidos. Entre las ranas el género más abundante es Eodiscoglossus.
Muy pocas son las salamandras que se conocen con esqueletos completos en el Mesozoico. En Las Hoyas, las salamandras son las formas más abundantes entre los anfibios y están representadas por dos especies totalmente diferentes: una totalmente metamorfoseada, Valdotriton, y una forma nueva perenibranquiada relacionada con Hylaeobatrachus (Evans y Milner, 1996). La primera podría vivir en torno a las aguas, mientras que la segunda sería totalmente acuática.
Los albanerpetóntidos son componentes importantes de la asociación de anfibios. Las Hoyas proporcionó el primer ejemplar completo conocido a escala mundial de Celtedens ibericus Los albanerpetóntidos son un grupo enigmático, cuyo registro se extiende desde el Jurásico hasta el Plioceno (McGowan y Evans, 995; McGowan, 2002). Gracias a estos ejemplares completos y articulados se ha podido confirmar que estos extraños animales forman un grupo natural separado, con una historia evolutiva independiente de las salamandras.Los albanerpetóntidos tendrían un modo de vida más terrestre que los demás anfibios, y hábitos tróficos muy especializados.
